综合新型冠状病毒肺炎的流行病学特点，发病迅速，传播很快，传染性极强，症状相似，当属于中医“疫病”或“瘟疫”范畴，而非“时病”。如清代雷丰所著《时病论》也明确将疫病排除在时病之外——“是书专为时病而设。时病者，乃感四时六气为病之证也，非时疫之时也”。明代吴又可《温疫论》曰：“夫温疫之为病，非风、非寒、非暑、非湿，乃天地间别有一种异气所感。”此处“异气”即“疫气”，是六气之外的一种气，为一种具有一定强传染性的“疫毒之气”。故该病病因为感受“疫戾”之气已很明确，但疫毒的性质目前还是不一致的。如仝小林提出新型冠状病毒肺炎在病性上属于阴病，是以伤阳为主线，为“寒湿疫”；董国菊结合患者临床表现发热、舌苔厚腻、口干、口苦、腹泻、大便黏滞不爽等，而武汉地处寒湿之地，加之冬季阳气潜藏于内，腠理闭塞，更容易郁而化热，从而提出为“湿热疫”；顾植山认为春节前后正值岁气交接之时，因而其病机时刻处在变化之中，但总体以燥和湿多见，因而提出为“燥湿疫”；王玉光认为本病的病因是以湿为基本属性的疫疠之气，从发病季节、气候以及病邪性质看，属于湿邪为主的疫疠范畴，称之为“湿毒疫”。亦有学者以病位命名该病，如吴伟等将之称为“肺疫病”。

温病又分为新感温病、伏气温病。有的学者认为新型冠状病毒肺炎为伏气温病，其理由是己亥年土不及，厥阴风木司天，少阳相火在泉。下半年是在泉的少阳相火主事，终之气主气为太阳寒水，客气为少阳相火。少阳相火加临，导致暖冬。春生夏长秋收冬藏，若终之气少阳相火加临，则冬不藏精，故春必温病，从而于己亥年终暴发。此外，正值冬天，阳气潜藏于内，加之武汉寒湿之地，腠理闭塞，更易郁而化热。然而大多学者认为新型冠状病毒肺炎不属于伏气温病，因其在全国各地甚至全世界各地均有传播，故应属于“新感”，而由于新型冠状病毒肺炎具有可传染、病状相似等特点，故也不是一般的“新感温病”，而属于“一气致一病”。明代吴又可《温疫论》认为：“盖当时适有某气，专入某脏腑某经络，专发为某病，故众人之病相同。”“疫毒之气”从口鼻而入则伤肺，因此新型冠状病毒肺炎致病特点也是病位首先在肺脏，临床表现也与一般温病相似。

总之，对于新型冠状病毒肺炎的病因即为感受“疫戾”之气，其病邪性质根据患者所处的地域、时间不同，而有所差异。目前比较一致观点是疫毒之邪性质以湿邪为主，故以“湿毒疫”命名更为确切。中国中部及北部地区，冬季气候严寒，所感之疫气可夹寒邪侵犯人体，故有寒湿表现；而南方诸省，即使冬季气候亦较温暖，感受邪气性质为湿热。但疫邪入内，亦随人之体质而有从化，平素气虚、阳虚体质者，从而化寒，但往往又郁而化热；阴虚火旺体质者，可从而化热，表现湿热征象。