南水北调工程按照政企分开、政事分开的原则，严格实行项目法人责任制、建设监理制、招标承包制和合同管理制。
南水北调工程建设以项目法人为主导，实行直接管理与委托管理相结合的建设管理方式。同时推行代建制管理，委托有资质有经验的建设管理单位或运行管理单位承担。
